MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli ED1a chromosome

Total Repeats: 107234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011745	T	8	8	1	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011745	AAC	2	6	28	33	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011745	CGG	2	6	52	57	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687879
4	NC_011745	CAGG	2	8	118	125	25 %	0 %	50 %	25 %	218687879
5	NC_011745	CT	3	6	143	148	0 %	50 %	0 %	50 %	218687879
6	NC_011745	ACCA	2	8	164	171	50 %	0 %	0 %	50 %	218687879
7	NC_011745	GAT	2	6	181	186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
8	NC_011745	A	6	6	189	194	100 %	0 %	0 %	0 %	218687879
9	NC_011745	CGC	3	9	268	276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687879
10	NC_011745	TCG	2	6	312	317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687879
11	NC_011745	TTG	2	6	362	367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687879
12	NC_011745	CGCTG	2	10	391	400	0 %	20 %	40 %	40 %	218687879
13	NC_011745	CTG	2	6	494	499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687879
14	NC_011745	CCG	2	6	547	552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687879
15	NC_011745	TGG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687879
16	NC_011745	ACT	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687879
17	NC_011745	GGC	2	6	676	681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687879
18	NC_011745	TTG	2	6	697	702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687879
19	NC_011745	GTT	2	6	766	771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687879
20	NC_011745	TTC	2	6	825	830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218687879
21	NC_011745	TGA	2	6	931	936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
22	NC_011745	GGC	2	6	1027	1032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687879
23	NC_011745	GC	3	6	1031	1036	0 %	0 %	50 %	50 %	218687879
24	NC_011745	GTG	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687879
25	NC_011745	ATC	2	6	1087	1092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687879
26	NC_011745	TG	3	6	1133	1138	0 %	50 %	50 %	0 %	218687879
27	NC_011745	AAG	2	6	1182	1187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687879
28	NC_011745	GGT	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687879
29	NC_011745	TCT	2	6	1334	1339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218687879
30	NC_011745	GAT	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
31	NC_011745	TCA	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687879
32	NC_011745	GCT	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687879
33	NC_011745	GAA	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687879
34	NC_011745	GAA	2	6	1601	1606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687879
35	NC_011745	ATC	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687879
36	NC_011745	TTG	2	6	1686	1691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687879
37	NC_011745	CCAG	2	8	1701	1708	25 %	0 %	25 %	50 %	218687879
38	NC_011745	GTT	2	6	1754	1759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687879
39	NC_011745	TCG	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687879
40	NC_011745	TAC	2	6	1796	1801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687879
41	NC_011745	GCG	2	6	1817	1822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687879
42	NC_011745	TGA	2	6	1912	1917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
43	NC_011745	TGA	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
44	NC_011745	GAT	2	6	2048	2053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
45	NC_011745	ATTGAA	2	12	2129	2140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218687879
46	NC_011745	TGC	2	6	2145	2150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687879
47	NC_011745	CGC	2	6	2179	2184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687879
48	NC_011745	CGA	2	6	2209	2214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687879
49	NC_011745	CG	3	6	2224	2229	0 %	0 %	50 %	50 %	218687879
50	NC_011745	TGA	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
51	NC_011745	TGA	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
52	NC_011745	TAT	2	6	2384	2389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218687879
53	NC_011745	GCG	2	6	2562	2567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687880
54	NC_011745	GGC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687880
55	NC_011745	CAA	2	6	2636	2641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218687880
56	NC_011745	GCAA	2	8	2728	2735	50 %	0 %	25 %	25 %	218687880
57	NC_011745	ATGA	2	8	2826	2833	50 %	25 %	25 %	0 %	218687880
58	NC_011745	GCT	2	6	2846	2851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687880
59	NC_011745	GCA	2	6	2905	2910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687880
60	NC_011745	TGG	2	6	2942	2947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687880
61	NC_011745	TGA	2	6	2956	2961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687880
62	NC_011745	GAA	2	6	2964	2969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687880
63	NC_011745	CAT	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687880
64	NC_011745	CAGC	2	8	2981	2988	25 %	0 %	25 %	50 %	218687880
65	NC_011745	TGA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687880
66	NC_011745	CGC	2	6	3084	3089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687880
67	NC_011745	ATTGC	2	10	3094	3103	20 %	40 %	20 %	20 %	218687880
68	NC_011745	TTCA	2	8	3126	3133	25 %	50 %	0 %	25 %	218687880
69	NC_011745	TGA	2	6	3172	3177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687880
70	NC_011745	AGCG	2	8	3263	3270	25 %	0 %	50 %	25 %	218687880
71	NC_011745	TCCGGC	2	12	3276	3287	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218687880
72	NC_011745	TG	3	6	3304	3309	0 %	50 %	50 %	0 %	218687880
73	NC_011745	CGG	2	6	3403	3408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687880
74	NC_011745	T	6	6	3519	3524	0 %	100 %	0 %	0 %	218687881
75	NC_011745	CTGA	2	8	3549	3556	25 %	25 %	25 %	25 %	218687881
76	NC_011745	TGA	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687881
77	NC_011745	TGA	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687881
78	NC_011745	GCG	2	6	3663	3668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687881
79	NC_011745	CGG	2	6	3758	3763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687881
80	NC_011745	GGC	2	6	3951	3956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687881
81	NC_011745	TGA	3	9	4022	4030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687881
82	NC_011745	TTA	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218687881
83	NC_011745	AAG	2	6	4135	4140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687881
84	NC_011745	GTTG	2	8	4151	4158	0 %	50 %	50 %	0 %	218687881
85	NC_011745	CGG	2	6	4192	4197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687881
86	NC_011745	CTG	2	6	4200	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687881
87	NC_011745	TGC	2	6	4241	4246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687881
88	NC_011745	ACG	2	6	4282	4287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687881
89	NC_011745	GATG	2	8	4331	4338	25 %	25 %	50 %	0 %	218687881
90	NC_011745	AGCC	2	8	4341	4348	25 %	0 %	25 %	50 %	218687881
91	NC_011745	AAC	2	6	4350	4355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218687881
92	NC_011745	GTT	2	6	4373	4378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687881
93	NC_011745	CCG	2	6	4379	4384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687881
94	NC_011745	GAT	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687881
95	NC_011745	AG	3	6	4580	4585	50 %	0 %	50 %	0 %	218687881
96	NC_011745	CCG	2	6	4672	4677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687881
97	NC_011745	TGC	2	6	4682	4687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687881
98	NC_011745	TGA	3	9	4699	4707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687881
99	NC_011745	ATC	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687881
100	NC_011745	T	6	6	4769	4774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011745	GAA	2	6	4777	4782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011745	AAC	2	6	4861	4866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011745	TGG	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687882
104	NC_011745	ACA	2	6	5105	5110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218687882
105	NC_011745	CCG	2	6	5148	5153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687882
106	NC_011745	CGC	2	6	5158	5163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687882
107	NC_011745	ATC	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687882
108	NC_011745	ATC	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687882
109	NC_011745	CAT	2	6	5217	5222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687882
110	NC_011745	GTT	2	6	5283	5288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687883
111	NC_011745	GGA	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218687883
112	NC_011745	TCA	2	6	5330	5335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687883
113	NC_011745	AAG	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687883
114	NC_011745	CAGT	2	8	5361	5368	25 %	25 %	25 %	25 %	218687883
115	NC_011745	AAT	2	6	5395	5400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218687883
116	NC_011745	TCA	2	6	5409	5414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687883
117	NC_011745	TTC	2	6	5462	5467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218687883
118	NC_011745	TTC	2	6	5507	5512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218687883
119	NC_011745	TGC	2	6	5572	5577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687883
120	NC_011745	TTG	2	6	5594	5599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687883
121	NC_011745	TGA	2	6	5601	5606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687883
122	NC_011745	AAATCG	2	12	5747	5758	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218687883
123	NC_011745	AGCG	2	8	5865	5872	25 %	0 %	50 %	25 %	218687883
124	NC_011745	GCT	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687883
125	NC_011745	GTG	2	6	5996	6001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687883
126	NC_011745	A	7	7	6091	6097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011745	CAT	2	6	6138	6143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687884
128	NC_011745	GCC	2	6	6355	6360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687884
129	NC_011745	GTT	2	6	6409	6414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687884
130	NC_011745	AGA	2	6	6426	6431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687884
131	NC_011745	ATC	2	6	6653	6658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687884
132	NC_011745	GCTGCC	2	12	6701	6712	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218687884
133	NC_011745	CGC	2	6	6799	6804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687884
134	NC_011745	GCC	2	6	6805	6810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687884
135	NC_011745	GCCA	2	8	6822	6829	25 %	0 %	25 %	50 %	218687884
136	NC_011745	CAGG	2	8	6895	6902	25 %	0 %	50 %	25 %	218687884
137	NC_011745	AAT	2	6	7003	7008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218687884
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139	NC_011745	AGA	2	6	7275	7280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687884
140	NC_011745	CGG	2	6	7296	7301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687884
141	NC_011745	CG	3	6	7341	7346	0 %	0 %	50 %	50 %	218687884
142	NC_011745	CAA	2	6	7475	7480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218687884
143	NC_011745	TAA	2	6	7530	7535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218687884
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145	NC_011745	GCAT	2	8	7551	7558	25 %	25 %	25 %	25 %	218687884
146	NC_011745	AAG	2	6	7614	7619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011745	TA	3	6	7620	7625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011745	GGCG	2	8	7682	7689	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011745	CGG	2	6	7746	7751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011745	CGT	2	6	7766	7771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_011745	ATC	2	6	7775	7780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_011745	ACC	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218687885
153	NC_011745	CAAC	2	8	7930	7937	50 %	0 %	0 %	50 %	218687885
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155	NC_011745	CGCAG	2	10	7955	7964	20 %	0 %	40 %	40 %	218687885
156	NC_011745	TTGA	2	8	7983	7990	25 %	50 %	25 %	0 %	218687885
157	NC_011745	CAG	2	6	8013	8018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687885
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159	NC_011745	CAG	2	6	8034	8039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687885
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161	NC_011745	TGC	2	6	8255	8260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687885
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165	NC_011745	AAGA	2	8	8406	8413	75 %	0 %	25 %	0 %	218687885
166	NC_011745	AGA	2	6	8426	8431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687885
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173	NC_011745	CTGT	2	8	8835	8842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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207	NC_011745	ATA	2	6	10335	10340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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233	NC_011745	CTG	2	6	11597	11602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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264	NC_011745	CGA	2	6	12543	12548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687890
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